CSVファイルによるインポート機能を使用してユーザの削除は行えますか？（たとえば削除用のフラグがある、など）

残念ながらCSVファイルインポートによるユーザの一括削除は行えません。

GUI管理ツールもしくはWebAdminのアカウントメニューより個別に削除を行ってください。