一部のユーザーのみIMAPを使用する予定ですが、ライセンスは別途必要ですか？

MDaemonは標準でSMTP/POP3/IMAPに対応しておりますので、ライセンスの追加はふようでございます。ユーザごとに仕様プロトコルを調整頂けます。