MailStore Serverを使って、特定の件名を含むメールだけをアーカイブしたいと思っています。フィルタリングの機能はありますか?

申し訳ありませんが、MailStoreはアーカイブに特化した製品となっているため、フィルタリングの機能は持っていません。

しかし、MDaemonといったメールサーバーと組み合わせることで、特定の条件に合致したメールのみアーカイブを行うことも可能です。