[Graphical User Interface]の頭文字です。
ＧＵＩはコマンド行でテキストを入力する代わりに、画面上のグラフィカルな要素をクリックすることによって、コンピュータあるいはアプリケーションとのコミュニケーションを可能にします。
Microsoft WindowsとMacintoshのオペレーティングシステムは両方ともＧＵＩベースで、最初にGUIを世に出したのはアップルですが、元々のアイデアはゼロックスが開発したものです。